[Vous devez être inscrit et connecté pour voir cette image]Très souvent considéré comme un poisson aimant les eaux pures et claires, il pourrait s'accomoder à de très nombreux milieux allant des eaux troubles à celles chargées en matière organique en passant par celles peu courantes à stagnantes. Il redoute les eaux trop froides surtout en période estivale (inférieure à 15°C)
Pour autant, le goujon est une espèce exigente vis à vis des fonds. Sa préférence va vers les sables et les graviers, l'espèce ayant tendance à fuir les substrats ( fond ) argileux et vaseux.
Il est grégaire et typiquement de fond. En rivière il se tient souvent au niveau des remous peu violents, à l'aval des ponts des écluses ou des ponts.
Durant l'été, il forme de petits bancs en eaux minces et tranquilles ; en hiver iil gagne des endroits plus profonds.
La croissance est lente : le goujon n'atteint 10 à 15 cm qu'au bout de 5 à 6 ans.